Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PKD2Q13563 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PKD2Q13563 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PKD2Q13563 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PKD2Q13563 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PKD2Q13563 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PKD2Q13563 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PKD2Q13563 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
PKD2Q13563 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PKD2Q13563 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PKD2Q13563 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PKD2Q13563 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PKD2Q13563 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PKD2Q13563 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PKD2Q13563 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PKD2Q13563 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PKD2Q13563 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PKD2Q13563 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PKD2Q13563 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PKD2Q13563 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PKD2Q13563 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
PKD2Q13563 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
PKD2Q13563 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PKD2Q13563 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PKD2Q13563 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PKD2Q13563 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PKD2Q13563 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PKD2Q13563 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PKD2Q13563 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PKD2Q13563 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PKD2Q13563 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PKD2Q13563 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PKD2Q13563 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PKD2Q13563 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PKD2Q13563 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PKD2Q13563 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PKD2Q13563 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PKD2Q13563 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PKD2Q13563 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PKD2Q13563 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PKD2Q13563 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PKD2Q13563 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
PKD2Q13563 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PKD2Q13563 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
PKD2Q13563 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PKD2Q13563 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
PKD2Q13563 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PKD2Q13563 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
PKD2Q13563 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PKD2Q13563 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PKD2Q13563 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PKD2Q13563 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PKD2Q13563 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PKD2Q13563 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PKD2Q13563 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PKD2Q13563 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PKD2Q13563 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PKD2Q13563 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PKD2Q13563 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PKD2Q13563 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PKD2Q13563 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PKD2Q13563 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PKD2Q13563 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PKD2Q13563 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PKD2Q13563 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PKD2Q13563 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PKD2Q13563 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PKD2Q13563 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PKD2Q13563 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PKD2Q13563 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PKD2Q13563 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PKD2Q13563 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PKD2Q13563 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PKD2Q13563 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PKD2Q13563 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PKD2Q13563 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PKD2Q13563 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PKD2Q13563 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PKD2Q13563 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PKD2Q13563 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PKD2Q13563 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PKD2Q13563 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PKD2Q13563 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PKD2Q13563 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PKD2Q13563 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PKD2Q13563 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PKD2Q13563 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PKD2Q13563 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PKD2Q13563 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PKD2Q13563 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PKD2Q13563 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PKD2Q13563 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PKD2Q13563 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PKD2Q13563 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PKD2Q13563 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PKD2Q13563 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PKD2Q13563 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PKD2Q13563 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PKD2Q13563 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PKD2Q13563 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms