Protein–RNA interactions for Protein: Q13541

EIF4EBP1, Eukaryotic translation initiation factor 4E-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4EBP1Q13541 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
EIF4EBP1Q13541 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms