Protein–RNA interactions for Protein: Q13491

GPM6B, Neuronal membrane glycoprotein M6-b, humanhuman

Predictions only

Length 265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPM6BQ13491 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GPM6BQ13491 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GPM6BQ13491 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GPM6BQ13491 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GPM6BQ13491 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GPM6BQ13491 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GPM6BQ13491 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GPM6BQ13491 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GPM6BQ13491 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GPM6BQ13491 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GPM6BQ13491 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GPM6BQ13491 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GPM6BQ13491 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GPM6BQ13491 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GPM6BQ13491 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GPM6BQ13491 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GPM6BQ13491 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GPM6BQ13491 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GPM6BQ13491 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GPM6BQ13491 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GPM6BQ13491 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GPM6BQ13491 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GPM6BQ13491 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
GPM6BQ13491 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
GPM6BQ13491 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GPM6BQ13491 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GPM6BQ13491 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GPM6BQ13491 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GPM6BQ13491 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GPM6BQ13491 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GPM6BQ13491 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GPM6BQ13491 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GPM6BQ13491 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GPM6BQ13491 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GPM6BQ13491 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GPM6BQ13491 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GPM6BQ13491 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GPM6BQ13491 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GPM6BQ13491 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GPM6BQ13491 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GPM6BQ13491 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GPM6BQ13491 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GPM6BQ13491 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GPM6BQ13491 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GPM6BQ13491 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GPM6BQ13491 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GPM6BQ13491 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GPM6BQ13491 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GPM6BQ13491 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GPM6BQ13491 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GPM6BQ13491 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GPM6BQ13491 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GPM6BQ13491 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GPM6BQ13491 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GPM6BQ13491 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GPM6BQ13491 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GPM6BQ13491 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GPM6BQ13491 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GPM6BQ13491 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GPM6BQ13491 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GPM6BQ13491 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GPM6BQ13491 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GPM6BQ13491 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GPM6BQ13491 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GPM6BQ13491 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GPM6BQ13491 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GPM6BQ13491 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GPM6BQ13491 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GPM6BQ13491 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GPM6BQ13491 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GPM6BQ13491 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GPM6BQ13491 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GPM6BQ13491 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GPM6BQ13491 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GPM6BQ13491 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GPM6BQ13491 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GPM6BQ13491 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GPM6BQ13491 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GPM6BQ13491 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GPM6BQ13491 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GPM6BQ13491 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GPM6BQ13491 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GPM6BQ13491 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GPM6BQ13491 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GPM6BQ13491 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GPM6BQ13491 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GPM6BQ13491 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GPM6BQ13491 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GPM6BQ13491 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GPM6BQ13491 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GPM6BQ13491 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GPM6BQ13491 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GPM6BQ13491 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GPM6BQ13491 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GPM6BQ13491 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GPM6BQ13491 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPM6BQ13491 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPM6BQ13491 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPM6BQ13491 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPM6BQ13491 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms