Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMAD4Q13485 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMAD4Q13485 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMAD4Q13485 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMAD4Q13485 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMAD4Q13485 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMAD4Q13485 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMAD4Q13485 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMAD4Q13485 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMAD4Q13485 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMAD4Q13485 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMAD4Q13485 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMAD4Q13485 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMAD4Q13485 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMAD4Q13485 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMAD4Q13485 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMAD4Q13485 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMAD4Q13485 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMAD4Q13485 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMAD4Q13485 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMAD4Q13485 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMAD4Q13485 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMAD4Q13485 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMAD4Q13485 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMAD4Q13485 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMAD4Q13485 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMAD4Q13485 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMAD4Q13485 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SMAD4Q13485 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMAD4Q13485 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SMAD4Q13485 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SMAD4Q13485 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SMAD4Q13485 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SMAD4Q13485 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMAD4Q13485 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms