Protein–RNA interactions for Protein: Q13291

SLAMF1, Signaling lymphocytic activation molecule, humanhuman

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Length 335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLAMF1Q13291 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLAMF1Q13291 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SLAMF1Q13291 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SLAMF1Q13291 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SLAMF1Q13291 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLAMF1Q13291 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLAMF1Q13291 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLAMF1Q13291 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLAMF1Q13291 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLAMF1Q13291 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLAMF1Q13291 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLAMF1Q13291 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLAMF1Q13291 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLAMF1Q13291 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLAMF1Q13291 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLAMF1Q13291 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLAMF1Q13291 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLAMF1Q13291 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SLAMF1Q13291 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLAMF1Q13291 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLAMF1Q13291 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLAMF1Q13291 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLAMF1Q13291 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLAMF1Q13291 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLAMF1Q13291 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLAMF1Q13291 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLAMF1Q13291 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLAMF1Q13291 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLAMF1Q13291 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLAMF1Q13291 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLAMF1Q13291 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLAMF1Q13291 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SLAMF1Q13291 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SLAMF1Q13291 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SLAMF1Q13291 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLAMF1Q13291 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLAMF1Q13291 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLAMF1Q13291 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLAMF1Q13291 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLAMF1Q13291 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLAMF1Q13291 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLAMF1Q13291 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLAMF1Q13291 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLAMF1Q13291 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLAMF1Q13291 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLAMF1Q13291 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLAMF1Q13291 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLAMF1Q13291 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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SLAMF1Q13291 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLAMF1Q13291 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLAMF1Q13291 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLAMF1Q13291 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLAMF1Q13291 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLAMF1Q13291 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLAMF1Q13291 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SLAMF1Q13291 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLAMF1Q13291 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLAMF1Q13291 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLAMF1Q13291 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLAMF1Q13291 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLAMF1Q13291 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLAMF1Q13291 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLAMF1Q13291 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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SLAMF1Q13291 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLAMF1Q13291 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
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SLAMF1Q13291 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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SLAMF1Q13291 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLAMF1Q13291 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLAMF1Q13291 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLAMF1Q13291 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLAMF1Q13291 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLAMF1Q13291 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLAMF1Q13291 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLAMF1Q13291 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLAMF1Q13291 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLAMF1Q13291 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLAMF1Q13291 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLAMF1Q13291 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLAMF1Q13291 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLAMF1Q13291 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLAMF1Q13291 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLAMF1Q13291 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLAMF1Q13291 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLAMF1Q13291 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLAMF1Q13291 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLAMF1Q13291 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLAMF1Q13291 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLAMF1Q13291 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLAMF1Q13291 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLAMF1Q13291 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLAMF1Q13291 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms