Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
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