Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CALCOCO2Q13137 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
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