Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NR1H3Q13133 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NR1H3Q13133 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NR1H3Q13133 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NR1H3Q13133 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
NR1H3Q13133 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NR1H3Q13133 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NR1H3Q13133 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NR1H3Q13133 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
NR1H3Q13133 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
NR1H3Q13133 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NR1H3Q13133 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NR1H3Q13133 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NR1H3Q13133 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NR1H3Q13133 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NR1H3Q13133 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NR1H3Q13133 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NR1H3Q13133 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NR1H3Q13133 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NR1H3Q13133 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NR1H3Q13133 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NR1H3Q13133 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NR1H3Q13133 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
NR1H3Q13133 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NR1H3Q13133 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NR1H3Q13133 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NR1H3Q13133 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NR1H3Q13133 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NR1H3Q13133 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NR1H3Q13133 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NR1H3Q13133 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NR1H3Q13133 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NR1H3Q13133 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NR1H3Q13133 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NR1H3Q13133 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
NR1H3Q13133 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NR1H3Q13133 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NR1H3Q13133 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NR1H3Q13133 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NR1H3Q13133 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NR1H3Q13133 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NR1H3Q13133 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
NR1H3Q13133 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NR1H3Q13133 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NR1H3Q13133 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NR1H3Q13133 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NR1H3Q13133 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
NR1H3Q13133 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NR1H3Q13133 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NR1H3Q13133 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NR1H3Q13133 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NR1H3Q13133 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NR1H3Q13133 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NR1H3Q13133 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NR1H3Q13133 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NR1H3Q13133 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NR1H3Q13133 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NR1H3Q13133 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NR1H3Q13133 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
NR1H3Q13133 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NR1H3Q13133 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NR1H3Q13133 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NR1H3Q13133 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NR1H3Q13133 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NR1H3Q13133 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NR1H3Q13133 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NR1H3Q13133 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NR1H3Q13133 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NR1H3Q13133 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NR1H3Q13133 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NR1H3Q13133 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NR1H3Q13133 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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