Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MKRN3Q13064 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MKRN3Q13064 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MKRN3Q13064 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MKRN3Q13064 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MKRN3Q13064 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MKRN3Q13064 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MKRN3Q13064 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MKRN3Q13064 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MKRN3Q13064 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MKRN3Q13064 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
MKRN3Q13064 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
MKRN3Q13064 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
MKRN3Q13064 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MKRN3Q13064 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MKRN3Q13064 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
MKRN3Q13064 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MKRN3Q13064 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MKRN3Q13064 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MKRN3Q13064 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MKRN3Q13064 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
MKRN3Q13064 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MKRN3Q13064 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MKRN3Q13064 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MKRN3Q13064 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MKRN3Q13064 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MKRN3Q13064 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MKRN3Q13064 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MKRN3Q13064 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MKRN3Q13064 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MKRN3Q13064 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MKRN3Q13064 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MKRN3Q13064 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MKRN3Q13064 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MKRN3Q13064 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MKRN3Q13064 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MKRN3Q13064 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MKRN3Q13064 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MKRN3Q13064 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MKRN3Q13064 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
MKRN3Q13064 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MKRN3Q13064 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MKRN3Q13064 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MKRN3Q13064 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MKRN3Q13064 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
MKRN3Q13064 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MKRN3Q13064 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MKRN3Q13064 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MKRN3Q13064 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MKRN3Q13064 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MKRN3Q13064 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MKRN3Q13064 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MKRN3Q13064 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MKRN3Q13064 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MKRN3Q13064 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MKRN3Q13064 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MKRN3Q13064 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MKRN3Q13064 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MKRN3Q13064 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
MKRN3Q13064 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MKRN3Q13064 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MKRN3Q13064 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MKRN3Q13064 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MKRN3Q13064 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MKRN3Q13064 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MKRN3Q13064 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MKRN3Q13064 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MKRN3Q13064 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MKRN3Q13064 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MKRN3Q13064 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MKRN3Q13064 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MKRN3Q13064 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
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MKRN3Q13064 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MKRN3Q13064 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MKRN3Q13064 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MKRN3Q13064 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MKRN3Q13064 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MKRN3Q13064 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MKRN3Q13064 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MKRN3Q13064 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MKRN3Q13064 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MKRN3Q13064 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MKRN3Q13064 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MKRN3Q13064 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MKRN3Q13064 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MKRN3Q13064 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MKRN3Q13064 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MKRN3Q13064 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MKRN3Q13064 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MKRN3Q13064 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MKRN3Q13064 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MKRN3Q13064 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MKRN3Q13064 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MKRN3Q13064 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MKRN3Q13064 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MKRN3Q13064 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MKRN3Q13064 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
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