Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
STRN3Q13033 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms