Protein–RNA interactions for Protein: Q12983

BNIP3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3Q12983 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BNIP3Q12983 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BNIP3Q12983 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BNIP3Q12983 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BNIP3Q12983 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BNIP3Q12983 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BNIP3Q12983 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BNIP3Q12983 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BNIP3Q12983 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BNIP3Q12983 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BNIP3Q12983 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BNIP3Q12983 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BNIP3Q12983 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BNIP3Q12983 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BNIP3Q12983 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BNIP3Q12983 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BNIP3Q12983 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BNIP3Q12983 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BNIP3Q12983 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BNIP3Q12983 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BNIP3Q12983 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BNIP3Q12983 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BNIP3Q12983 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BNIP3Q12983 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BNIP3Q12983 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BNIP3Q12983 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BNIP3Q12983 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BNIP3Q12983 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BNIP3Q12983 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BNIP3Q12983 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BNIP3Q12983 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BNIP3Q12983 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
BNIP3Q12983 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BNIP3Q12983 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
BNIP3Q12983 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BNIP3Q12983 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BNIP3Q12983 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BNIP3Q12983 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BNIP3Q12983 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BNIP3Q12983 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BNIP3Q12983 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BNIP3Q12983 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
BNIP3Q12983 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
BNIP3Q12983 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BNIP3Q12983 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BNIP3Q12983 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BNIP3Q12983 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BNIP3Q12983 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BNIP3Q12983 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BNIP3Q12983 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BNIP3Q12983 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
BNIP3Q12983 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BNIP3Q12983 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BNIP3Q12983 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BNIP3Q12983 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BNIP3Q12983 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BNIP3Q12983 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BNIP3Q12983 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BNIP3Q12983 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BNIP3Q12983 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
BNIP3Q12983 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BNIP3Q12983 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BNIP3Q12983 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
BNIP3Q12983 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BNIP3Q12983 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BNIP3Q12983 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BNIP3Q12983 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BNIP3Q12983 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BNIP3Q12983 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BNIP3Q12983 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BNIP3Q12983 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BNIP3Q12983 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BNIP3Q12983 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BNIP3Q12983 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BNIP3Q12983 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BNIP3Q12983 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BNIP3Q12983 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BNIP3Q12983 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BNIP3Q12983 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BNIP3Q12983 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BNIP3Q12983 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BNIP3Q12983 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
BNIP3Q12983 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BNIP3Q12983 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BNIP3Q12983 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BNIP3Q12983 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BNIP3Q12983 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BNIP3Q12983 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BNIP3Q12983 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BNIP3Q12983 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BNIP3Q12983 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BNIP3Q12983 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BNIP3Q12983 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BNIP3Q12983 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BNIP3Q12983 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BNIP3Q12983 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BNIP3Q12983 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BNIP3Q12983 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BNIP3Q12983 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BNIP3Q12983 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
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