Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTP4A2Q12974 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
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