Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NFIAQ12857 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NFIAQ12857 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NFIAQ12857 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NFIAQ12857 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NFIAQ12857 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NFIAQ12857 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NFIAQ12857 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NFIAQ12857 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NFIAQ12857 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NFIAQ12857 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NFIAQ12857 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NFIAQ12857 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NFIAQ12857 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NFIAQ12857 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NFIAQ12857 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NFIAQ12857 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NFIAQ12857 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NFIAQ12857 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NFIAQ12857 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NFIAQ12857 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NFIAQ12857 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NFIAQ12857 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NFIAQ12857 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NFIAQ12857 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NFIAQ12857 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NFIAQ12857 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NFIAQ12857 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NFIAQ12857 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NFIAQ12857 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NFIAQ12857 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NFIAQ12857 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NFIAQ12857 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NFIAQ12857 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NFIAQ12857 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NFIAQ12857 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NFIAQ12857 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NFIAQ12857 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NFIAQ12857 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NFIAQ12857 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NFIAQ12857 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NFIAQ12857 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NFIAQ12857 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NFIAQ12857 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NFIAQ12857 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NFIAQ12857 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NFIAQ12857 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NFIAQ12857 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NFIAQ12857 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NFIAQ12857 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NFIAQ12857 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
NFIAQ12857 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NFIAQ12857 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NFIAQ12857 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NFIAQ12857 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
NFIAQ12857 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NFIAQ12857 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
NFIAQ12857 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
NFIAQ12857 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
NFIAQ12857 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
NFIAQ12857 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
NFIAQ12857 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.87
NFIAQ12857 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
NFIAQ12857 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NFIAQ12857 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NFIAQ12857 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NFIAQ12857 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NFIAQ12857 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
NFIAQ12857 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NFIAQ12857 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NFIAQ12857 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NFIAQ12857 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NFIAQ12857 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NFIAQ12857 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NFIAQ12857 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NFIAQ12857 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NFIAQ12857 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NFIAQ12857 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NFIAQ12857 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NFIAQ12857 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NFIAQ12857 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NFIAQ12857 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NFIAQ12857 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NFIAQ12857 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NFIAQ12857 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
NFIAQ12857 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NFIAQ12857 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NFIAQ12857 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NFIAQ12857 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NFIAQ12857 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NFIAQ12857 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NFIAQ12857 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NFIAQ12857 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
NFIAQ12857 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NFIAQ12857 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NFIAQ12857 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NFIAQ12857 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NFIAQ12857 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NFIAQ12857 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NFIAQ12857 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
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