Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
STX4Q12846 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
STX4Q12846 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
STX4Q12846 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
STX4Q12846 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
STX4Q12846 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
STX4Q12846 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
STX4Q12846 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
STX4Q12846 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
STX4Q12846 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
STX4Q12846 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
STX4Q12846 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
STX4Q12846 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
STX4Q12846 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
STX4Q12846 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
STX4Q12846 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
STX4Q12846 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
STX4Q12846 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
STX4Q12846 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
STX4Q12846 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
STX4Q12846 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
STX4Q12846 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
STX4Q12846 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
STX4Q12846 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
STX4Q12846 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
STX4Q12846 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
STX4Q12846 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
STX4Q12846 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
STX4Q12846 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
STX4Q12846 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
STX4Q12846 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
STX4Q12846 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
STX4Q12846 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
STX4Q12846 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
STX4Q12846 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
STX4Q12846 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
STX4Q12846 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
STX4Q12846 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
STX4Q12846 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
STX4Q12846 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
STX4Q12846 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
STX4Q12846 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
STX4Q12846 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
STX4Q12846 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
STX4Q12846 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
STX4Q12846 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
STX4Q12846 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
STX4Q12846 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
STX4Q12846 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
STX4Q12846 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
STX4Q12846 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
STX4Q12846 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
STX4Q12846 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
STX4Q12846 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
STX4Q12846 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
STX4Q12846 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
STX4Q12846 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
STX4Q12846 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
STX4Q12846 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
STX4Q12846 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
STX4Q12846 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
STX4Q12846 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
STX4Q12846 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
STX4Q12846 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
STX4Q12846 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
STX4Q12846 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
STX4Q12846 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
STX4Q12846 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
STX4Q12846 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
STX4Q12846 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
STX4Q12846 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
STX4Q12846 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
STX4Q12846 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
STX4Q12846 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
STX4Q12846 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
STX4Q12846 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
STX4Q12846 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
STX4Q12846 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
STX4Q12846 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
STX4Q12846 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
STX4Q12846 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
STX4Q12846 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
STX4Q12846 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
STX4Q12846 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
STX4Q12846 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
STX4Q12846 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
STX4Q12846 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
STX4Q12846 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
STX4Q12846 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
STX4Q12846 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
STX4Q12846 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
STX4Q12846 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
STX4Q12846 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
STX4Q12846 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
STX4Q12846 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
STX4Q12846 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
STX4Q12846 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
STX4Q12846 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
STX4Q12846 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
STX4Q12846 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms