Protein–RNA interactions for Protein: Q12800

TFCP2, Alpha-globin transcription factor CP2, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFCP2Q12800 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TFCP2Q12800 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TFCP2Q12800 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TFCP2Q12800 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TFCP2Q12800 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TFCP2Q12800 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TFCP2Q12800 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TFCP2Q12800 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TFCP2Q12800 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TFCP2Q12800 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TFCP2Q12800 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TFCP2Q12800 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TFCP2Q12800 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TFCP2Q12800 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TFCP2Q12800 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TFCP2Q12800 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TFCP2Q12800 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TFCP2Q12800 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TFCP2Q12800 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TFCP2Q12800 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TFCP2Q12800 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TFCP2Q12800 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TFCP2Q12800 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TFCP2Q12800 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TFCP2Q12800 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TFCP2Q12800 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TFCP2Q12800 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TFCP2Q12800 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TFCP2Q12800 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TFCP2Q12800 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TFCP2Q12800 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TFCP2Q12800 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TFCP2Q12800 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TFCP2Q12800 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TFCP2Q12800 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TFCP2Q12800 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TFCP2Q12800 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TFCP2Q12800 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TFCP2Q12800 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TFCP2Q12800 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TFCP2Q12800 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TFCP2Q12800 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TFCP2Q12800 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TFCP2Q12800 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TFCP2Q12800 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TFCP2Q12800 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TFCP2Q12800 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TFCP2Q12800 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TFCP2Q12800 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TFCP2Q12800 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TFCP2Q12800 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TFCP2Q12800 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TFCP2Q12800 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TFCP2Q12800 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TFCP2Q12800 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TFCP2Q12800 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TFCP2Q12800 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TFCP2Q12800 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TFCP2Q12800 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TFCP2Q12800 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TFCP2Q12800 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TFCP2Q12800 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TFCP2Q12800 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TFCP2Q12800 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TFCP2Q12800 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TFCP2Q12800 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TFCP2Q12800 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TFCP2Q12800 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TFCP2Q12800 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TFCP2Q12800 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TFCP2Q12800 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TFCP2Q12800 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TFCP2Q12800 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TFCP2Q12800 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TFCP2Q12800 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TFCP2Q12800 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TFCP2Q12800 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TFCP2Q12800 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TFCP2Q12800 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TFCP2Q12800 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TFCP2Q12800 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TFCP2Q12800 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TFCP2Q12800 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TFCP2Q12800 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TFCP2Q12800 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TFCP2Q12800 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TFCP2Q12800 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TFCP2Q12800 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TFCP2Q12800 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TFCP2Q12800 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TFCP2Q12800 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TFCP2Q12800 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TFCP2Q12800 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TFCP2Q12800 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TFCP2Q12800 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TFCP2Q12800 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TFCP2Q12800 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TFCP2Q12800 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TFCP2Q12800 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TFCP2Q12800 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms