Protein–RNA interactions for Protein: Q08623

PUDP, Pseudouridine-5'-phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUDPQ08623 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms