Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE4DQ08499 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE4DQ08499 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE4DQ08499 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE4DQ08499 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE4DQ08499 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE4DQ08499 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE4DQ08499 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE4DQ08499 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE4DQ08499 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE4DQ08499 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE4DQ08499 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE4DQ08499 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDE4DQ08499 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDE4DQ08499 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDE4DQ08499 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PDE4DQ08499 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDE4DQ08499 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDE4DQ08499 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDE4DQ08499 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PDE4DQ08499 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PDE4DQ08499 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDE4DQ08499 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDE4DQ08499 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDE4DQ08499 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDE4DQ08499 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDE4DQ08499 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PDE4DQ08499 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PDE4DQ08499 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PDE4DQ08499 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PDE4DQ08499 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PDE4DQ08499 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PDE4DQ08499 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE4DQ08499 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE4DQ08499 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE4DQ08499 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE4DQ08499 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE4DQ08499 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE4DQ08499 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE4DQ08499 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE4DQ08499 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE4DQ08499 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE4DQ08499 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE4DQ08499 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE4DQ08499 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE4DQ08499 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE4DQ08499 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE4DQ08499 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE4DQ08499 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE4DQ08499 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE4DQ08499 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE4DQ08499 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE4DQ08499 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE4DQ08499 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE4DQ08499 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE4DQ08499 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE4DQ08499 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE4DQ08499 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE4DQ08499 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE4DQ08499 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE4DQ08499 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE4DQ08499 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE4DQ08499 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDE4DQ08499 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PDE4DQ08499 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDE4DQ08499 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDE4DQ08499 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDE4DQ08499 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDE4DQ08499 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDE4DQ08499 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDE4DQ08499 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDE4DQ08499 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDE4DQ08499 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDE4DQ08499 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDE4DQ08499 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDE4DQ08499 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDE4DQ08499 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDE4DQ08499 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDE4DQ08499 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PDE4DQ08499 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDE4DQ08499 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDE4DQ08499 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDE4DQ08499 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDE4DQ08499 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDE4DQ08499 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDE4DQ08499 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDE4DQ08499 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDE4DQ08499 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDE4DQ08499 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDE4DQ08499 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDE4DQ08499 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDE4DQ08499 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDE4DQ08499 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDE4DQ08499 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDE4DQ08499 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PDE4DQ08499 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PDE4DQ08499 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PDE4DQ08499 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PDE4DQ08499 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PDE4DQ08499 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms