Protein–RNA interactions for Protein: Q07699

SCN1B, Sodium channel subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN1BQ07699 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SCN1BQ07699 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SCN1BQ07699 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SCN1BQ07699 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SCN1BQ07699 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SCN1BQ07699 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SCN1BQ07699 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SCN1BQ07699 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SCN1BQ07699 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SCN1BQ07699 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SCN1BQ07699 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SCN1BQ07699 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SCN1BQ07699 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SCN1BQ07699 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SCN1BQ07699 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
SCN1BQ07699 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms