Protein–RNA interactions for Protein: Q07654

TFF3, Trefoil factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF3Q07654 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TFF3Q07654 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms