Protein–RNA interactions for Protein: Q05940

SLC18A2, Synaptic vesicular amine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A2Q05940 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC18A2Q05940 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC18A2Q05940 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC18A2Q05940 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC18A2Q05940 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC18A2Q05940 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC18A2Q05940 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC18A2Q05940 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC18A2Q05940 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC18A2Q05940 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC18A2Q05940 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC18A2Q05940 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC18A2Q05940 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC18A2Q05940 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC18A2Q05940 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC18A2Q05940 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC18A2Q05940 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC18A2Q05940 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC18A2Q05940 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC18A2Q05940 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC18A2Q05940 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC18A2Q05940 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC18A2Q05940 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC18A2Q05940 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC18A2Q05940 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC18A2Q05940 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC18A2Q05940 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC18A2Q05940 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC18A2Q05940 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC18A2Q05940 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC18A2Q05940 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC18A2Q05940 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC18A2Q05940 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC18A2Q05940 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC18A2Q05940 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC18A2Q05940 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC18A2Q05940 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC18A2Q05940 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC18A2Q05940 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC18A2Q05940 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC18A2Q05940 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC18A2Q05940 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC18A2Q05940 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC18A2Q05940 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC18A2Q05940 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC18A2Q05940 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC18A2Q05940 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC18A2Q05940 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC18A2Q05940 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC18A2Q05940 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC18A2Q05940 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC18A2Q05940 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC18A2Q05940 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC18A2Q05940 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC18A2Q05940 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC18A2Q05940 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC18A2Q05940 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC18A2Q05940 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC18A2Q05940 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC18A2Q05940 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC18A2Q05940 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC18A2Q05940 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC18A2Q05940 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC18A2Q05940 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC18A2Q05940 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC18A2Q05940 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC18A2Q05940 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC18A2Q05940 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC18A2Q05940 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC18A2Q05940 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC18A2Q05940 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC18A2Q05940 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC18A2Q05940 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC18A2Q05940 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC18A2Q05940 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC18A2Q05940 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC18A2Q05940 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC18A2Q05940 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC18A2Q05940 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC18A2Q05940 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC18A2Q05940 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC18A2Q05940 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC18A2Q05940 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC18A2Q05940 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC18A2Q05940 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC18A2Q05940 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC18A2Q05940 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC18A2Q05940 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC18A2Q05940 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC18A2Q05940 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC18A2Q05940 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC18A2Q05940 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC18A2Q05940 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC18A2Q05940 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC18A2Q05940 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC18A2Q05940 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC18A2Q05940 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC18A2Q05940 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC18A2Q05940 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC18A2Q05940 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms