Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPN12Q05209 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPN12Q05209 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPN12Q05209 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPN12Q05209 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPN12Q05209 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPN12Q05209 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPN12Q05209 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPN12Q05209 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPN12Q05209 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPN12Q05209 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPN12Q05209 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPN12Q05209 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPN12Q05209 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPN12Q05209 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPN12Q05209 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPN12Q05209 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPN12Q05209 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPN12Q05209 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPN12Q05209 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPN12Q05209 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPN12Q05209 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPN12Q05209 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPN12Q05209 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPN12Q05209 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPN12Q05209 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPN12Q05209 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPN12Q05209 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPN12Q05209 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPN12Q05209 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPN12Q05209 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPN12Q05209 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPN12Q05209 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
PTPN12Q05209 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPN12Q05209 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPN12Q05209 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPN12Q05209 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPN12Q05209 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPN12Q05209 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPN12Q05209 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPN12Q05209 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPN12Q05209 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPN12Q05209 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPN12Q05209 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPN12Q05209 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPN12Q05209 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPN12Q05209 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPN12Q05209 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPN12Q05209 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPN12Q05209 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPN12Q05209 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPN12Q05209 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPN12Q05209 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPN12Q05209 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPN12Q05209 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPN12Q05209 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPN12Q05209 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPN12Q05209 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPN12Q05209 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPN12Q05209 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPN12Q05209 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPN12Q05209 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPN12Q05209 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPN12Q05209 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPN12Q05209 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPN12Q05209 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPN12Q05209 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPN12Q05209 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPN12Q05209 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPN12Q05209 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPN12Q05209 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPN12Q05209 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPN12Q05209 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPN12Q05209 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPN12Q05209 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPN12Q05209 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPN12Q05209 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPN12Q05209 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPN12Q05209 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPN12Q05209 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPN12Q05209 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPN12Q05209 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPN12Q05209 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPN12Q05209 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPN12Q05209 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPN12Q05209 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPN12Q05209 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPN12Q05209 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPN12Q05209 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPN12Q05209 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPN12Q05209 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPN12Q05209 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPN12Q05209 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPN12Q05209 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPN12Q05209 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPN12Q05209 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPN12Q05209 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPN12Q05209 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPN12Q05209 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPN12Q05209 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms