Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms