Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
ERCC6Q03468 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
ERCC6Q03468 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
ERCC6Q03468 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
ERCC6Q03468 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
ERCC6Q03468 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ERCC6Q03468 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ERCC6Q03468 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ERCC6Q03468 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ERCC6Q03468 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ERCC6Q03468 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ERCC6Q03468 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ERCC6Q03468 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ERCC6Q03468 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ERCC6Q03468 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ERCC6Q03468 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ERCC6Q03468 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ERCC6Q03468 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ERCC6Q03468 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ERCC6Q03468 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ERCC6Q03468 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ERCC6Q03468 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ERCC6Q03468 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ERCC6Q03468 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ERCC6Q03468 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
ERCC6Q03468 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ERCC6Q03468 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ERCC6Q03468 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ERCC6Q03468 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ERCC6Q03468 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ERCC6Q03468 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
ERCC6Q03468 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ERCC6Q03468 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ERCC6Q03468 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ERCC6Q03468 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ERCC6Q03468 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ERCC6Q03468 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ERCC6Q03468 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ERCC6Q03468 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ERCC6Q03468 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ERCC6Q03468 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ERCC6Q03468 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ERCC6Q03468 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ERCC6Q03468 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ERCC6Q03468 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
ERCC6Q03468 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ERCC6Q03468 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ERCC6Q03468 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ERCC6Q03468 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
ERCC6Q03468 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ERCC6Q03468 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ERCC6Q03468 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ERCC6Q03468 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ERCC6Q03468 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ERCC6Q03468 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ERCC6Q03468 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ERCC6Q03468 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ERCC6Q03468 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ERCC6Q03468 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ERCC6Q03468 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ERCC6Q03468 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ERCC6Q03468 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ERCC6Q03468 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ERCC6Q03468 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ERCC6Q03468 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
ERCC6Q03468 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ERCC6Q03468 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ERCC6Q03468 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ERCC6Q03468 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ERCC6Q03468 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ERCC6Q03468 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ERCC6Q03468 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ERCC6Q03468 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ERCC6Q03468 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ERCC6Q03468 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ERCC6Q03468 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ERCC6Q03468 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ERCC6Q03468 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ERCC6Q03468 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ERCC6Q03468 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ERCC6Q03468 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ERCC6Q03468 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ERCC6Q03468 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ERCC6Q03468 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ERCC6Q03468 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ERCC6Q03468 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ERCC6Q03468 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ERCC6Q03468 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
ERCC6Q03468 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ERCC6Q03468 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ERCC6Q03468 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
ERCC6Q03468 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ERCC6Q03468 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
ERCC6Q03468 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ERCC6Q03468 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ERCC6Q03468 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ERCC6Q03468 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
ERCC6Q03468 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
ERCC6Q03468 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.29
ERCC6Q03468 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms