Protein–RNA interactions for Protein: Q02509

OC90, Otoconin-90, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OC90Q02509 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
OC90Q02509 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
OC90Q02509 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
OC90Q02509 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
OC90Q02509 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
OC90Q02509 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
OC90Q02509 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
OC90Q02509 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
OC90Q02509 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
OC90Q02509 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
OC90Q02509 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
OC90Q02509 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
OC90Q02509 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
OC90Q02509 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
OC90Q02509 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
OC90Q02509 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
OC90Q02509 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
OC90Q02509 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
OC90Q02509 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
OC90Q02509 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
OC90Q02509 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
OC90Q02509 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
OC90Q02509 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
OC90Q02509 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
OC90Q02509 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
OC90Q02509 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
OC90Q02509 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
OC90Q02509 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
OC90Q02509 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
OC90Q02509 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
OC90Q02509 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
OC90Q02509 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
OC90Q02509 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
OC90Q02509 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
OC90Q02509 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
OC90Q02509 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
OC90Q02509 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
OC90Q02509 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
OC90Q02509 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
OC90Q02509 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
OC90Q02509 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
OC90Q02509 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
OC90Q02509 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
OC90Q02509 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
OC90Q02509 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
OC90Q02509 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
OC90Q02509 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
OC90Q02509 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
OC90Q02509 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
OC90Q02509 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
OC90Q02509 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
OC90Q02509 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
OC90Q02509 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
OC90Q02509 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
OC90Q02509 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
OC90Q02509 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
OC90Q02509 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
OC90Q02509 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
OC90Q02509 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
OC90Q02509 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
OC90Q02509 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
OC90Q02509 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
OC90Q02509 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
OC90Q02509 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
OC90Q02509 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
OC90Q02509 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
OC90Q02509 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
OC90Q02509 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
OC90Q02509 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
OC90Q02509 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
OC90Q02509 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
OC90Q02509 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
OC90Q02509 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
OC90Q02509 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
OC90Q02509 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
OC90Q02509 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
OC90Q02509 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
OC90Q02509 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
OC90Q02509 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
OC90Q02509 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
OC90Q02509 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
OC90Q02509 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
OC90Q02509 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
OC90Q02509 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
OC90Q02509 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
OC90Q02509 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
OC90Q02509 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
OC90Q02509 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
OC90Q02509 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
OC90Q02509 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
OC90Q02509 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
OC90Q02509 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
OC90Q02509 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
OC90Q02509 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
OC90Q02509 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
OC90Q02509 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
OC90Q02509 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
OC90Q02509 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
OC90Q02509 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
OC90Q02509 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms