Protein–RNA interactions for Protein: Q02297

NRG1, Pro-neuregulin-1, membrane-bound isoform, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRG1Q02297 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NRG1Q02297 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NRG1Q02297 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NRG1Q02297 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NRG1Q02297 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NRG1Q02297 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NRG1Q02297 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NRG1Q02297 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NRG1Q02297 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NRG1Q02297 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NRG1Q02297 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NRG1Q02297 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NRG1Q02297 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
NRG1Q02297 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
NRG1Q02297 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
NRG1Q02297 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NRG1Q02297 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NRG1Q02297 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NRG1Q02297 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NRG1Q02297 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NRG1Q02297 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NRG1Q02297 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NRG1Q02297 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NRG1Q02297 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NRG1Q02297 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NRG1Q02297 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NRG1Q02297 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NRG1Q02297 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NRG1Q02297 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NRG1Q02297 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NRG1Q02297 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NRG1Q02297 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NRG1Q02297 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NRG1Q02297 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NRG1Q02297 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NRG1Q02297 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NRG1Q02297 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NRG1Q02297 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NRG1Q02297 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NRG1Q02297 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NRG1Q02297 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NRG1Q02297 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NRG1Q02297 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NRG1Q02297 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
NRG1Q02297 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NRG1Q02297 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
NRG1Q02297 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NRG1Q02297 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NRG1Q02297 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NRG1Q02297 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
NRG1Q02297 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NRG1Q02297 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NRG1Q02297 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
NRG1Q02297 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
NRG1Q02297 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NRG1Q02297 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NRG1Q02297 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NRG1Q02297 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NRG1Q02297 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NRG1Q02297 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NRG1Q02297 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NRG1Q02297 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NRG1Q02297 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NRG1Q02297 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NRG1Q02297 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NRG1Q02297 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NRG1Q02297 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NRG1Q02297 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NRG1Q02297 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NRG1Q02297 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NRG1Q02297 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NRG1Q02297 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NRG1Q02297 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NRG1Q02297 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NRG1Q02297 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NRG1Q02297 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NRG1Q02297 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NRG1Q02297 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NRG1Q02297 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NRG1Q02297 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NRG1Q02297 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NRG1Q02297 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NRG1Q02297 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NRG1Q02297 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
NRG1Q02297 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NRG1Q02297 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
NRG1Q02297 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NRG1Q02297 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NRG1Q02297 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NRG1Q02297 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NRG1Q02297 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NRG1Q02297 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NRG1Q02297 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NRG1Q02297 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NRG1Q02297 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
NRG1Q02297 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NRG1Q02297 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NRG1Q02297 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NRG1Q02297 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NRG1Q02297 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms