Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFRSF17Q02223 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms