Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MDM2Q00987 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MDM2Q00987 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MDM2Q00987 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MDM2Q00987 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MDM2Q00987 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MDM2Q00987 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MDM2Q00987 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MDM2Q00987 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
MDM2Q00987 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MDM2Q00987 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MDM2Q00987 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MDM2Q00987 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
MDM2Q00987 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
MDM2Q00987 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
MDM2Q00987 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MDM2Q00987 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MDM2Q00987 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MDM2Q00987 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MDM2Q00987 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MDM2Q00987 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MDM2Q00987 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MDM2Q00987 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MDM2Q00987 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MDM2Q00987 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MDM2Q00987 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MDM2Q00987 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MDM2Q00987 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
MDM2Q00987 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MDM2Q00987 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MDM2Q00987 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MDM2Q00987 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MDM2Q00987 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MDM2Q00987 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MDM2Q00987 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MDM2Q00987 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MDM2Q00987 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MDM2Q00987 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MDM2Q00987 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MDM2Q00987 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
MDM2Q00987 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MDM2Q00987 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MDM2Q00987 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MDM2Q00987 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MDM2Q00987 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
MDM2Q00987 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MDM2Q00987 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MDM2Q00987 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MDM2Q00987 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MDM2Q00987 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MDM2Q00987 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MDM2Q00987 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MDM2Q00987 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MDM2Q00987 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MDM2Q00987 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MDM2Q00987 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MDM2Q00987 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
MDM2Q00987 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
MDM2Q00987 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
MDM2Q00987 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
MDM2Q00987 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MDM2Q00987 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MDM2Q00987 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MDM2Q00987 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MDM2Q00987 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MDM2Q00987 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MDM2Q00987 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MDM2Q00987 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MDM2Q00987 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MDM2Q00987 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MDM2Q00987 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MDM2Q00987 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MDM2Q00987 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MDM2Q00987 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MDM2Q00987 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MDM2Q00987 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MDM2Q00987 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MDM2Q00987 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MDM2Q00987 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MDM2Q00987 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MDM2Q00987 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MDM2Q00987 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MDM2Q00987 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MDM2Q00987 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
MDM2Q00987 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
MDM2Q00987 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MDM2Q00987 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MDM2Q00987 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MDM2Q00987 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
MDM2Q00987 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MDM2Q00987 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MDM2Q00987 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
MDM2Q00987 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MDM2Q00987 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MDM2Q00987 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MDM2Q00987 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MDM2Q00987 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MDM2Q00987 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MDM2Q00987 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MDM2Q00987 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms