Protein–RNA interactions for Protein: Q00888

PSG4, Pregnancy-specific beta-1-glycoprotein 4, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSG4Q00888 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms