Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms