Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 625.2 ms