Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM3AP98173 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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