Protein–RNA interactions for Protein: P59666

DEFA3, Neutrophil defensin 3, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA3P59666 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEFA3P59666 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEFA3P59666 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEFA3P59666 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEFA3P59666 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEFA3P59666 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEFA3P59666 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEFA3P59666 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEFA3P59666 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEFA3P59666 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DEFA3P59666 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DEFA3P59666 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DEFA3P59666 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEFA3P59666 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEFA3P59666 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEFA3P59666 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEFA3P59666 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEFA3P59666 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEFA3P59666 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEFA3P59666 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEFA3P59666 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEFA3P59666 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEFA3P59666 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEFA3P59666 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEFA3P59666 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEFA3P59666 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEFA3P59666 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEFA3P59666 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEFA3P59666 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEFA3P59666 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEFA3P59666 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEFA3P59666 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEFA3P59666 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEFA3P59666 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEFA3P59666 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEFA3P59666 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEFA3P59666 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEFA3P59666 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DEFA3P59666 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEFA3P59666 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEFA3P59666 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEFA3P59666 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEFA3P59666 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DEFA3P59666 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEFA3P59666 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEFA3P59666 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEFA3P59666 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEFA3P59666 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEFA3P59666 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEFA3P59666 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEFA3P59666 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEFA3P59666 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEFA3P59666 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEFA3P59666 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEFA3P59666 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEFA3P59666 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEFA3P59666 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEFA3P59666 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEFA3P59666 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEFA3P59666 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DEFA3P59666 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEFA3P59666 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEFA3P59666 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEFA3P59666 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DEFA3P59666 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEFA3P59666 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEFA3P59666 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEFA3P59666 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEFA3P59666 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEFA3P59666 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEFA3P59666 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEFA3P59666 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEFA3P59666 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEFA3P59666 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DEFA3P59666 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DEFA3P59666 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DEFA3P59666 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DEFA3P59666 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
DEFA3P59666 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DEFA3P59666 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DEFA3P59666 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DEFA3P59666 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DEFA3P59666 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DEFA3P59666 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DEFA3P59666 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DEFA3P59666 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DEFA3P59666 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DEFA3P59666 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
DEFA3P59666 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DEFA3P59666 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DEFA3P59666 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DEFA3P59666 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DEFA3P59666 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
DEFA3P59666 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DEFA3P59666 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DEFA3P59666 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DEFA3P59666 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DEFA3P59666 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DEFA3P59666 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DEFA3P59666 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms