Protein–RNA interactions for Protein: P59665

DEFA1, Neutrophil defensin 1, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA1P59665 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms