Protein–RNA interactions for Protein: P55087

AQP4, Aquaporin-4, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AQP4P55087 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
AQP4P55087 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AQP4P55087 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
AQP4P55087 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AQP4P55087 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
AQP4P55087 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AQP4P55087 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
AQP4P55087 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AQP4P55087 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AQP4P55087 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AQP4P55087 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AQP4P55087 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AQP4P55087 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AQP4P55087 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AQP4P55087 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
AQP4P55087 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AQP4P55087 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AQP4P55087 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AQP4P55087 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AQP4P55087 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AQP4P55087 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AQP4P55087 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
AQP4P55087 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
AQP4P55087 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
AQP4P55087 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AQP4P55087 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AQP4P55087 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AQP4P55087 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AQP4P55087 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AQP4P55087 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AQP4P55087 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AQP4P55087 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AQP4P55087 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AQP4P55087 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AQP4P55087 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AQP4P55087 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AQP4P55087 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AQP4P55087 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AQP4P55087 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AQP4P55087 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AQP4P55087 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AQP4P55087 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AQP4P55087 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AQP4P55087 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AQP4P55087 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AQP4P55087 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AQP4P55087 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AQP4P55087 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AQP4P55087 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AQP4P55087 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AQP4P55087 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AQP4P55087 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AQP4P55087 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AQP4P55087 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AQP4P55087 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AQP4P55087 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AQP4P55087 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
AQP4P55087 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AQP4P55087 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AQP4P55087 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AQP4P55087 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AQP4P55087 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AQP4P55087 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AQP4P55087 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
AQP4P55087 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AQP4P55087 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AQP4P55087 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AQP4P55087 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AQP4P55087 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AQP4P55087 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AQP4P55087 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AQP4P55087 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AQP4P55087 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AQP4P55087 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AQP4P55087 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AQP4P55087 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AQP4P55087 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AQP4P55087 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AQP4P55087 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AQP4P55087 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AQP4P55087 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AQP4P55087 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AQP4P55087 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AQP4P55087 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AQP4P55087 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AQP4P55087 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AQP4P55087 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AQP4P55087 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AQP4P55087 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AQP4P55087 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AQP4P55087 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AQP4P55087 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AQP4P55087 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AQP4P55087 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AQP4P55087 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AQP4P55087 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AQP4P55087 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AQP4P55087 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AQP4P55087 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AQP4P55087 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms