Protein–RNA interactions for Protein: P53621

COPA, Coatomer subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPAP53621 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COPAP53621 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COPAP53621 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COPAP53621 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COPAP53621 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COPAP53621 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COPAP53621 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COPAP53621 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COPAP53621 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
COPAP53621 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COPAP53621 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COPAP53621 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COPAP53621 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COPAP53621 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COPAP53621 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COPAP53621 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COPAP53621 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COPAP53621 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COPAP53621 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COPAP53621 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COPAP53621 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COPAP53621 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COPAP53621 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COPAP53621 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COPAP53621 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COPAP53621 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COPAP53621 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COPAP53621 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COPAP53621 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COPAP53621 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COPAP53621 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COPAP53621 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COPAP53621 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COPAP53621 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COPAP53621 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COPAP53621 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COPAP53621 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COPAP53621 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COPAP53621 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COPAP53621 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COPAP53621 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COPAP53621 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COPAP53621 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COPAP53621 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COPAP53621 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COPAP53621 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
COPAP53621 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COPAP53621 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COPAP53621 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COPAP53621 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COPAP53621 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COPAP53621 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COPAP53621 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COPAP53621 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COPAP53621 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COPAP53621 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COPAP53621 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
COPAP53621 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COPAP53621 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COPAP53621 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
COPAP53621 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
COPAP53621 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COPAP53621 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COPAP53621 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COPAP53621 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COPAP53621 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COPAP53621 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
COPAP53621 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
COPAP53621 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
COPAP53621 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
COPAP53621 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COPAP53621 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
COPAP53621 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COPAP53621 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
COPAP53621 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COPAP53621 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COPAP53621 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COPAP53621 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COPAP53621 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COPAP53621 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COPAP53621 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COPAP53621 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COPAP53621 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
COPAP53621 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COPAP53621 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COPAP53621 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
COPAP53621 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COPAP53621 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
COPAP53621 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
COPAP53621 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
COPAP53621 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
COPAP53621 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
COPAP53621 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
COPAP53621 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COPAP53621 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
COPAP53621 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COPAP53621 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
COPAP53621 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COPAP53621 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COPAP53621 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 174.7 ms