Protein–RNA interactions for Protein: P46939

UTRN, Utrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTRNP46939 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UTRNP46939 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UTRNP46939 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UTRNP46939 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UTRNP46939 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UTRNP46939 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
UTRNP46939 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
UTRNP46939 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
UTRNP46939 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UTRNP46939 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
UTRNP46939 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
UTRNP46939 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
UTRNP46939 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UTRNP46939 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UTRNP46939 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UTRNP46939 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
UTRNP46939 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
UTRNP46939 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
UTRNP46939 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UTRNP46939 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UTRNP46939 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
UTRNP46939 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UTRNP46939 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
UTRNP46939 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UTRNP46939 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UTRNP46939 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UTRNP46939 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
UTRNP46939 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UTRNP46939 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
UTRNP46939 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
UTRNP46939 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
UTRNP46939 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UTRNP46939 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UTRNP46939 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
UTRNP46939 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
UTRNP46939 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UTRNP46939 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UTRNP46939 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
UTRNP46939 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
UTRNP46939 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
UTRNP46939 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
UTRNP46939 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UTRNP46939 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UTRNP46939 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
UTRNP46939 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
UTRNP46939 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
UTRNP46939 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
UTRNP46939 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
UTRNP46939 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
UTRNP46939 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
UTRNP46939 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
UTRNP46939 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
UTRNP46939 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
UTRNP46939 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
UTRNP46939 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
UTRNP46939 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
UTRNP46939 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
UTRNP46939 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
UTRNP46939 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
UTRNP46939 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
UTRNP46939 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
UTRNP46939 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
UTRNP46939 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
UTRNP46939 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
UTRNP46939 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
UTRNP46939 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
UTRNP46939 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
UTRNP46939 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
UTRNP46939 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
UTRNP46939 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
UTRNP46939 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
UTRNP46939 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
UTRNP46939 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
UTRNP46939 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
UTRNP46939 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
UTRNP46939 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
UTRNP46939 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
UTRNP46939 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
UTRNP46939 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
UTRNP46939 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
UTRNP46939 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
UTRNP46939 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
UTRNP46939 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
UTRNP46939 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
UTRNP46939 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
UTRNP46939 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
UTRNP46939 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
UTRNP46939 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
UTRNP46939 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
UTRNP46939 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
UTRNP46939 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
UTRNP46939 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
UTRNP46939 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
UTRNP46939 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
UTRNP46939 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
UTRNP46939 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
UTRNP46939 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
UTRNP46939 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
UTRNP46939 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
UTRNP46939 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms