Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACADSBP45954 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACADSBP45954 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACADSBP45954 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ACADSBP45954 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACADSBP45954 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACADSBP45954 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACADSBP45954 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACADSBP45954 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACADSBP45954 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACADSBP45954 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACADSBP45954 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACADSBP45954 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACADSBP45954 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACADSBP45954 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACADSBP45954 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACADSBP45954 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACADSBP45954 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACADSBP45954 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACADSBP45954 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ACADSBP45954 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACADSBP45954 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACADSBP45954 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACADSBP45954 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACADSBP45954 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACADSBP45954 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACADSBP45954 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACADSBP45954 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACADSBP45954 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACADSBP45954 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACADSBP45954 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACADSBP45954 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACADSBP45954 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACADSBP45954 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACADSBP45954 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACADSBP45954 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACADSBP45954 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACADSBP45954 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACADSBP45954 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACADSBP45954 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACADSBP45954 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACADSBP45954 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACADSBP45954 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACADSBP45954 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACADSBP45954 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACADSBP45954 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACADSBP45954 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACADSBP45954 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACADSBP45954 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACADSBP45954 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACADSBP45954 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACADSBP45954 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACADSBP45954 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACADSBP45954 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACADSBP45954 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ACADSBP45954 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACADSBP45954 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACADSBP45954 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACADSBP45954 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACADSBP45954 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ACADSBP45954 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ACADSBP45954 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ACADSBP45954 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACADSBP45954 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACADSBP45954 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACADSBP45954 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACADSBP45954 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACADSBP45954 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACADSBP45954 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACADSBP45954 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACADSBP45954 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACADSBP45954 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACADSBP45954 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACADSBP45954 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACADSBP45954 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACADSBP45954 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACADSBP45954 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACADSBP45954 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACADSBP45954 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACADSBP45954 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACADSBP45954 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACADSBP45954 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACADSBP45954 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACADSBP45954 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACADSBP45954 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACADSBP45954 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACADSBP45954 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACADSBP45954 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACADSBP45954 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACADSBP45954 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACADSBP45954 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACADSBP45954 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACADSBP45954 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACADSBP45954 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ACADSBP45954 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ACADSBP45954 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ACADSBP45954 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ACADSBP45954 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ACADSBP45954 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ACADSBP45954 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms