Protein–RNA interactions for Protein: P43304

GPD2, Glycerol-3-phosphate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 727 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPD2P43304 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GPD2P43304 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GPD2P43304 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
GPD2P43304 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GPD2P43304 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
GPD2P43304 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
GPD2P43304 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
GPD2P43304 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
GPD2P43304 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GPD2P43304 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
GPD2P43304 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GPD2P43304 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GPD2P43304 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
GPD2P43304 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GPD2P43304 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GPD2P43304 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GPD2P43304 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GPD2P43304 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GPD2P43304 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GPD2P43304 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GPD2P43304 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GPD2P43304 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GPD2P43304 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GPD2P43304 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GPD2P43304 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GPD2P43304 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GPD2P43304 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GPD2P43304 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GPD2P43304 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GPD2P43304 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GPD2P43304 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GPD2P43304 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GPD2P43304 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GPD2P43304 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GPD2P43304 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GPD2P43304 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GPD2P43304 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GPD2P43304 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GPD2P43304 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GPD2P43304 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GPD2P43304 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GPD2P43304 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GPD2P43304 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GPD2P43304 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GPD2P43304 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GPD2P43304 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GPD2P43304 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GPD2P43304 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GPD2P43304 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GPD2P43304 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GPD2P43304 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GPD2P43304 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GPD2P43304 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GPD2P43304 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GPD2P43304 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GPD2P43304 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GPD2P43304 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GPD2P43304 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GPD2P43304 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GPD2P43304 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GPD2P43304 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
GPD2P43304 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GPD2P43304 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GPD2P43304 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GPD2P43304 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GPD2P43304 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GPD2P43304 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GPD2P43304 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GPD2P43304 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GPD2P43304 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GPD2P43304 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GPD2P43304 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GPD2P43304 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GPD2P43304 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GPD2P43304 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GPD2P43304 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GPD2P43304 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
GPD2P43304 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GPD2P43304 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GPD2P43304 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GPD2P43304 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GPD2P43304 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
GPD2P43304 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GPD2P43304 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GPD2P43304 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GPD2P43304 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GPD2P43304 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GPD2P43304 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GPD2P43304 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GPD2P43304 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GPD2P43304 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GPD2P43304 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GPD2P43304 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GPD2P43304 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GPD2P43304 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GPD2P43304 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GPD2P43304 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GPD2P43304 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GPD2P43304 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GPD2P43304 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms