Protein–RNA interactions for Protein: P42025

ACTR1B, Beta-centractin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR1BP42025 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTR1BP42025 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTR1BP42025 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTR1BP42025 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTR1BP42025 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTR1BP42025 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTR1BP42025 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTR1BP42025 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTR1BP42025 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTR1BP42025 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTR1BP42025 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTR1BP42025 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTR1BP42025 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTR1BP42025 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTR1BP42025 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ACTR1BP42025 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ACTR1BP42025 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ACTR1BP42025 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ACTR1BP42025 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACTR1BP42025 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACTR1BP42025 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACTR1BP42025 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACTR1BP42025 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACTR1BP42025 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACTR1BP42025 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACTR1BP42025 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ACTR1BP42025 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ACTR1BP42025 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACTR1BP42025 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACTR1BP42025 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACTR1BP42025 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACTR1BP42025 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACTR1BP42025 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ACTR1BP42025 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACTR1BP42025 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ACTR1BP42025 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ACTR1BP42025 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACTR1BP42025 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACTR1BP42025 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACTR1BP42025 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACTR1BP42025 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACTR1BP42025 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACTR1BP42025 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACTR1BP42025 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACTR1BP42025 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACTR1BP42025 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACTR1BP42025 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACTR1BP42025 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACTR1BP42025 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACTR1BP42025 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACTR1BP42025 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTR1BP42025 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTR1BP42025 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTR1BP42025 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTR1BP42025 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTR1BP42025 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTR1BP42025 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTR1BP42025 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTR1BP42025 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTR1BP42025 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTR1BP42025 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTR1BP42025 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTR1BP42025 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTR1BP42025 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTR1BP42025 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTR1BP42025 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTR1BP42025 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTR1BP42025 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTR1BP42025 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTR1BP42025 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTR1BP42025 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTR1BP42025 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTR1BP42025 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTR1BP42025 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTR1BP42025 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTR1BP42025 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTR1BP42025 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTR1BP42025 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTR1BP42025 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTR1BP42025 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTR1BP42025 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTR1BP42025 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTR1BP42025 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTR1BP42025 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTR1BP42025 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTR1BP42025 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACTR1BP42025 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACTR1BP42025 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACTR1BP42025 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACTR1BP42025 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACTR1BP42025 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACTR1BP42025 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACTR1BP42025 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACTR1BP42025 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ACTR1BP42025 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ACTR1BP42025 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACTR1BP42025 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACTR1BP42025 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACTR1BP42025 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACTR1BP42025 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms