Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms