Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATP5C1P36542 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP5C1P36542 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP5C1P36542 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP5C1P36542 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP5C1P36542 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms