Protein–RNA interactions for Protein: P35638

DDIT3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT3P35638 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DDIT3P35638 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DDIT3P35638 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DDIT3P35638 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DDIT3P35638 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DDIT3P35638 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DDIT3P35638 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DDIT3P35638 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
DDIT3P35638 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
DDIT3P35638 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DDIT3P35638 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DDIT3P35638 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
DDIT3P35638 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DDIT3P35638 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
DDIT3P35638 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
DDIT3P35638 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DDIT3P35638 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DDIT3P35638 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DDIT3P35638 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DDIT3P35638 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DDIT3P35638 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DDIT3P35638 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DDIT3P35638 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DDIT3P35638 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DDIT3P35638 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DDIT3P35638 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DDIT3P35638 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DDIT3P35638 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DDIT3P35638 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DDIT3P35638 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DDIT3P35638 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DDIT3P35638 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DDIT3P35638 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DDIT3P35638 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DDIT3P35638 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DDIT3P35638 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
DDIT3P35638 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DDIT3P35638 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DDIT3P35638 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
DDIT3P35638 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DDIT3P35638 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DDIT3P35638 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DDIT3P35638 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DDIT3P35638 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DDIT3P35638 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DDIT3P35638 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DDIT3P35638 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DDIT3P35638 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DDIT3P35638 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DDIT3P35638 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DDIT3P35638 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DDIT3P35638 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DDIT3P35638 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
DDIT3P35638 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DDIT3P35638 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DDIT3P35638 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DDIT3P35638 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DDIT3P35638 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DDIT3P35638 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DDIT3P35638 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DDIT3P35638 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DDIT3P35638 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DDIT3P35638 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DDIT3P35638 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DDIT3P35638 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DDIT3P35638 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DDIT3P35638 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DDIT3P35638 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DDIT3P35638 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DDIT3P35638 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DDIT3P35638 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DDIT3P35638 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DDIT3P35638 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DDIT3P35638 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
DDIT3P35638 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DDIT3P35638 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DDIT3P35638 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DDIT3P35638 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DDIT3P35638 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DDIT3P35638 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DDIT3P35638 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DDIT3P35638 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DDIT3P35638 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
DDIT3P35638 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DDIT3P35638 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DDIT3P35638 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DDIT3P35638 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DDIT3P35638 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DDIT3P35638 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DDIT3P35638 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DDIT3P35638 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DDIT3P35638 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DDIT3P35638 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DDIT3P35638 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DDIT3P35638 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DDIT3P35638 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DDIT3P35638 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DDIT3P35638 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DDIT3P35638 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DDIT3P35638 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms