Protein–RNA interactions for Protein: P35443

THBS4, Thrombospondin-4, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS4P35443 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
THBS4P35443 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
THBS4P35443 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
THBS4P35443 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
THBS4P35443 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
THBS4P35443 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
THBS4P35443 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
THBS4P35443 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
THBS4P35443 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
THBS4P35443 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
THBS4P35443 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
THBS4P35443 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
THBS4P35443 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
THBS4P35443 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
THBS4P35443 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
THBS4P35443 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
THBS4P35443 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
THBS4P35443 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
THBS4P35443 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
THBS4P35443 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
THBS4P35443 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
THBS4P35443 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
THBS4P35443 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
THBS4P35443 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
THBS4P35443 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
THBS4P35443 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
THBS4P35443 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
THBS4P35443 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
THBS4P35443 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
THBS4P35443 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
THBS4P35443 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
THBS4P35443 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
THBS4P35443 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
THBS4P35443 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
THBS4P35443 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
THBS4P35443 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
THBS4P35443 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
THBS4P35443 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
THBS4P35443 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
THBS4P35443 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
THBS4P35443 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
THBS4P35443 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
THBS4P35443 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
THBS4P35443 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
THBS4P35443 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
THBS4P35443 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
THBS4P35443 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
THBS4P35443 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
THBS4P35443 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
THBS4P35443 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
THBS4P35443 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
THBS4P35443 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
THBS4P35443 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
THBS4P35443 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
THBS4P35443 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
THBS4P35443 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
THBS4P35443 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
THBS4P35443 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
THBS4P35443 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
THBS4P35443 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
THBS4P35443 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
THBS4P35443 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
THBS4P35443 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
THBS4P35443 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
THBS4P35443 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
THBS4P35443 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
THBS4P35443 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
THBS4P35443 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
THBS4P35443 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
THBS4P35443 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
THBS4P35443 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
THBS4P35443 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
THBS4P35443 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
THBS4P35443 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
THBS4P35443 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
THBS4P35443 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
THBS4P35443 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
THBS4P35443 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
THBS4P35443 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
THBS4P35443 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
THBS4P35443 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
THBS4P35443 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
THBS4P35443 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
THBS4P35443 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
THBS4P35443 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
THBS4P35443 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
THBS4P35443 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
THBS4P35443 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
THBS4P35443 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
THBS4P35443 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
THBS4P35443 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
THBS4P35443 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
THBS4P35443 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
THBS4P35443 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
THBS4P35443 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
THBS4P35443 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
THBS4P35443 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
THBS4P35443 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
THBS4P35443 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
THBS4P35443 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.9 ms