Protein–RNA interactions for Protein: P33527

ABCC1, Multidrug resistance-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC1P33527 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ABCC1P33527 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ABCC1P33527 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
ABCC1P33527 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ABCC1P33527 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
ABCC1P33527 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
ABCC1P33527 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ABCC1P33527 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ABCC1P33527 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ABCC1P33527 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ABCC1P33527 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ABCC1P33527 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ABCC1P33527 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ABCC1P33527 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ABCC1P33527 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ABCC1P33527 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ABCC1P33527 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ABCC1P33527 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ABCC1P33527 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ABCC1P33527 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ABCC1P33527 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
ABCC1P33527 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ABCC1P33527 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ABCC1P33527 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ABCC1P33527 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ABCC1P33527 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ABCC1P33527 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ABCC1P33527 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ABCC1P33527 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ABCC1P33527 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ABCC1P33527 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ABCC1P33527 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
ABCC1P33527 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ABCC1P33527 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ABCC1P33527 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ABCC1P33527 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ABCC1P33527 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ABCC1P33527 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ABCC1P33527 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ABCC1P33527 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ABCC1P33527 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ABCC1P33527 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
ABCC1P33527 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ABCC1P33527 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ABCC1P33527 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ABCC1P33527 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ABCC1P33527 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
ABCC1P33527 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ABCC1P33527 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ABCC1P33527 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ABCC1P33527 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ABCC1P33527 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ABCC1P33527 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ABCC1P33527 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ABCC1P33527 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ABCC1P33527 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ABCC1P33527 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ABCC1P33527 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ABCC1P33527 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ABCC1P33527 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ABCC1P33527 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ABCC1P33527 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ABCC1P33527 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ABCC1P33527 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
ABCC1P33527 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
ABCC1P33527 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ABCC1P33527 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ABCC1P33527 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ABCC1P33527 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ABCC1P33527 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ABCC1P33527 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ABCC1P33527 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ABCC1P33527 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ABCC1P33527 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ABCC1P33527 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ABCC1P33527 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ABCC1P33527 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ABCC1P33527 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ABCC1P33527 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ABCC1P33527 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
ABCC1P33527 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ABCC1P33527 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ABCC1P33527 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ABCC1P33527 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ABCC1P33527 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ABCC1P33527 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ABCC1P33527 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ABCC1P33527 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ABCC1P33527 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ABCC1P33527 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ABCC1P33527 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ABCC1P33527 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ABCC1P33527 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ABCC1P33527 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ABCC1P33527 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ABCC1P33527 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ABCC1P33527 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ABCC1P33527 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ABCC1P33527 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ABCC1P33527 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms