Protein–RNA interactions for Protein: P31644

GABRA5, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA5P31644 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRA5P31644 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRA5P31644 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRA5P31644 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRA5P31644 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRA5P31644 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRA5P31644 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRA5P31644 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRA5P31644 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRA5P31644 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRA5P31644 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRA5P31644 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRA5P31644 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRA5P31644 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRA5P31644 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRA5P31644 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRA5P31644 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRA5P31644 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRA5P31644 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRA5P31644 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRA5P31644 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRA5P31644 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRA5P31644 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRA5P31644 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRA5P31644 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRA5P31644 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRA5P31644 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRA5P31644 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRA5P31644 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRA5P31644 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRA5P31644 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRA5P31644 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRA5P31644 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRA5P31644 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRA5P31644 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRA5P31644 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRA5P31644 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRA5P31644 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRA5P31644 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRA5P31644 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRA5P31644 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRA5P31644 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRA5P31644 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRA5P31644 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRA5P31644 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRA5P31644 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRA5P31644 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRA5P31644 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRA5P31644 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GABRA5P31644 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GABRA5P31644 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GABRA5P31644 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GABRA5P31644 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
GABRA5P31644 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GABRA5P31644 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms