Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms