Protein–RNA interactions for Protein: P30622

CLIP1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1P30622 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2
CLIP1P30622 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
CLIP1P30622 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
CLIP1P30622 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
CLIP1P30622 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CLIP1P30622 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CLIP1P30622 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CLIP1P30622 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CLIP1P30622 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CLIP1P30622 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CLIP1P30622 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CLIP1P30622 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CLIP1P30622 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CLIP1P30622 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CLIP1P30622 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
CLIP1P30622 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CLIP1P30622 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
CLIP1P30622 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
CLIP1P30622 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CLIP1P30622 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CLIP1P30622 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CLIP1P30622 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CLIP1P30622 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CLIP1P30622 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CLIP1P30622 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CLIP1P30622 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CLIP1P30622 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CLIP1P30622 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
CLIP1P30622 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
CLIP1P30622 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CLIP1P30622 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CLIP1P30622 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CLIP1P30622 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CLIP1P30622 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CLIP1P30622 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CLIP1P30622 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CLIP1P30622 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CLIP1P30622 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CLIP1P30622 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CLIP1P30622 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CLIP1P30622 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CLIP1P30622 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CLIP1P30622 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CLIP1P30622 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CLIP1P30622 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CLIP1P30622 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CLIP1P30622 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CLIP1P30622 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CLIP1P30622 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
CLIP1P30622 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CLIP1P30622 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CLIP1P30622 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CLIP1P30622 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CLIP1P30622 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CLIP1P30622 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CLIP1P30622 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CLIP1P30622 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CLIP1P30622 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CLIP1P30622 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CLIP1P30622 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CLIP1P30622 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CLIP1P30622 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CLIP1P30622 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CLIP1P30622 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CLIP1P30622 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CLIP1P30622 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CLIP1P30622 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CLIP1P30622 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CLIP1P30622 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CLIP1P30622 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
CLIP1P30622 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CLIP1P30622 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC27.54■■■□□ 2
CLIP1P30622 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CLIP1P30622 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
CLIP1P30622 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CLIP1P30622 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
CLIP1P30622 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CLIP1P30622 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC27.54■■■□□ 2
CLIP1P30622 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CLIP1P30622 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CLIP1P30622 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC27.54■■■□□ 2
CLIP1P30622 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CLIP1P30622 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CLIP1P30622 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CLIP1P30622 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CLIP1P30622 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CLIP1P30622 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CLIP1P30622 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CLIP1P30622 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CLIP1P30622 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CLIP1P30622 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CLIP1P30622 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CLIP1P30622 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CLIP1P30622 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC27.53■■■□□ 2
CLIP1P30622 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC27.53■■■□□ 2
CLIP1P30622 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CLIP1P30622 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CLIP1P30622 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
CLIP1P30622 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CLIP1P30622 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms