Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPRMP28827 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPRMP28827 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPRMP28827 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPRMP28827 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPRMP28827 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPRMP28827 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPRMP28827 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPRMP28827 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPRMP28827 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPRMP28827 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPRMP28827 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPRMP28827 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPRMP28827 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPRMP28827 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPRMP28827 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPRMP28827 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPRMP28827 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPRMP28827 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPRMP28827 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPRMP28827 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPRMP28827 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPRMP28827 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPRMP28827 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPRMP28827 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPRMP28827 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPRMP28827 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPRMP28827 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPRMP28827 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPRMP28827 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPRMP28827 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPRMP28827 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPRMP28827 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPRMP28827 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPRMP28827 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPRMP28827 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPRMP28827 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPRMP28827 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPRMP28827 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPRMP28827 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPRMP28827 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPRMP28827 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPRMP28827 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPRMP28827 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPRMP28827 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPRMP28827 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPRMP28827 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRMP28827 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRMP28827 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRMP28827 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRMP28827 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRMP28827 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRMP28827 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRMP28827 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRMP28827 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRMP28827 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRMP28827 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRMP28827 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRMP28827 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRMP28827 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRMP28827 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRMP28827 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRMP28827 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRMP28827 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRMP28827 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRMP28827 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRMP28827 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRMP28827 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRMP28827 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRMP28827 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRMP28827 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPRMP28827 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPRMP28827 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPRMP28827 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPRMP28827 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPRMP28827 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPRMP28827 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPRMP28827 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPRMP28827 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPRMP28827 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPRMP28827 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPRMP28827 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPRMP28827 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPRMP28827 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPRMP28827 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPRMP28827 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPRMP28827 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPRMP28827 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPRMP28827 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPRMP28827 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPRMP28827 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPRMP28827 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPRMP28827 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPRMP28827 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPRMP28827 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPRMP28827 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPRMP28827 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPRMP28827 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPRMP28827 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPRMP28827 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
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