Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GCAP28676 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GCAP28676 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GCAP28676 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GCAP28676 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GCAP28676 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GCAP28676 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GCAP28676 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GCAP28676 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GCAP28676 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GCAP28676 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GCAP28676 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GCAP28676 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GCAP28676 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GCAP28676 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GCAP28676 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GCAP28676 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
GCAP28676 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GCAP28676 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GCAP28676 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
GCAP28676 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GCAP28676 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GCAP28676 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GCAP28676 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GCAP28676 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GCAP28676 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GCAP28676 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GCAP28676 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GCAP28676 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GCAP28676 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
GCAP28676 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GCAP28676 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GCAP28676 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GCAP28676 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GCAP28676 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GCAP28676 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GCAP28676 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GCAP28676 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GCAP28676 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GCAP28676 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
GCAP28676 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GCAP28676 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GCAP28676 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GCAP28676 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GCAP28676 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GCAP28676 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GCAP28676 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GCAP28676 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GCAP28676 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GCAP28676 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GCAP28676 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
GCAP28676 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GCAP28676 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GCAP28676 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GCAP28676 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GCAP28676 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GCAP28676 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GCAP28676 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GCAP28676 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GCAP28676 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GCAP28676 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GCAP28676 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GCAP28676 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GCAP28676 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GCAP28676 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GCAP28676 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GCAP28676 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GCAP28676 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GCAP28676 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GCAP28676 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GCAP28676 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GCAP28676 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GCAP28676 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GCAP28676 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GCAP28676 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GCAP28676 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GCAP28676 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GCAP28676 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
GCAP28676 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GCAP28676 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GCAP28676 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GCAP28676 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GCAP28676 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GCAP28676 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GCAP28676 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GCAP28676 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GCAP28676 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GCAP28676 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GCAP28676 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GCAP28676 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GCAP28676 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GCAP28676 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GCAP28676 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GCAP28676 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GCAP28676 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GCAP28676 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GCAP28676 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GCAP28676 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GCAP28676 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GCAP28676 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms