Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
POLD1P28340 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
POLD1P28340 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
POLD1P28340 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
POLD1P28340 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
POLD1P28340 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
POLD1P28340 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
POLD1P28340 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
POLD1P28340 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
POLD1P28340 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
POLD1P28340 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
POLD1P28340 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
POLD1P28340 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
POLD1P28340 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
POLD1P28340 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLD1P28340 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLD1P28340 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLD1P28340 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLD1P28340 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLD1P28340 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLD1P28340 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLD1P28340 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLD1P28340 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLD1P28340 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLD1P28340 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
POLD1P28340 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLD1P28340 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLD1P28340 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLD1P28340 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLD1P28340 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLD1P28340 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLD1P28340 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLD1P28340 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
POLD1P28340 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLD1P28340 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLD1P28340 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
POLD1P28340 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLD1P28340 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLD1P28340 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLD1P28340 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLD1P28340 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLD1P28340 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLD1P28340 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLD1P28340 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLD1P28340 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
POLD1P28340 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLD1P28340 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLD1P28340 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLD1P28340 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLD1P28340 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
POLD1P28340 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLD1P28340 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLD1P28340 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
POLD1P28340 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
POLD1P28340 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLD1P28340 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLD1P28340 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLD1P28340 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLD1P28340 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLD1P28340 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLD1P28340 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
POLD1P28340 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLD1P28340 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLD1P28340 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLD1P28340 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLD1P28340 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLD1P28340 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLD1P28340 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLD1P28340 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLD1P28340 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLD1P28340 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLD1P28340 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLD1P28340 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
POLD1P28340 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLD1P28340 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLD1P28340 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLD1P28340 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLD1P28340 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLD1P28340 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLD1P28340 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLD1P28340 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLD1P28340 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLD1P28340 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
POLD1P28340 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLD1P28340 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLD1P28340 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLD1P28340 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
POLD1P28340 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLD1P28340 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLD1P28340 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLD1P28340 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLD1P28340 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLD1P28340 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLD1P28340 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLD1P28340 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLD1P28340 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLD1P28340 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLD1P28340 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLD1P28340 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLD1P28340 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms